Det var under ett seminarium på Stockholms universitet på onsdagen, där Dagan pratade om det kommande israeliska valet, som en åhörare kastade en sko mot honom. En person kastade också en bok.
Det är oklart om ambassadören träffades, men seminariet fortsatte efter ett kort avbrott.
Två personer greps, misstänkta för misshandel respektive störande av allmän sammankomst.