Glos har också ofta i media framfört krav om snabba skattesänkningar, något som Merkel vid upprepade tillfällen har avfärdat.
Glos kommer från Bayern och tillhör CSU, det bayerska systerpartiet till Merkels kristdemokratiska CDU.
Den 64-årige Glos blev ekonomiminister 2005 i Merkels första regering.
Enligt tyska medier kommer Glos att ersättas av CSU:s generalsekreterare, den 37-årige Karl-Theodor zu Guttenberg.